En un caluroso verano en Akihabara, el autoproclamado “científico loco” Rintarou Okabe y sus amigos inventan accidentalmente una máquina capaz de enviar mensajes al pasado usando un microondas modificado. Lo que empieza como un juego de curiosidad pronto se convierte en una peligrosa carrera contra el tiempo, cuando organizaciones secretas y paradojas temporales amenazan con cambiar el destino de todos. Entre risas, amistad y dolorosas decisiones, Okabe debe enfrentar las consecuencias de alterar la línea temporal y descubrir hasta dónde está dispuesto a llegar para proteger a quienes ama.